El proceso tecnológico de secuenciación del genoma del virus SARS-CoV-2 utilizando la máquina secuenciadora de nueva generación PacBio es el resultado de un proyecto científico asignado por la Academia de Ciencia y Tecnología de Vietnam al Instituto de Biotecnología con el fin de satisfacer las necesidades de apoyo al control del covid-19 en el país.

El profesor y doctor Truong Nam Hai, líder del proyecto, ha afirmado que el Instituto de Biotecnología, en colaboración con el Instituto Pasteur en Ciudad Ho Chi Minh y el Instituto Nacional de Higiene y Epidemiología, ha desarrollado una técnica para secuenciar todo el genoma del nuevo coronavirus utilizando dicha tecnología.

El programa ha secuenciado el genoma completo de cuatro cepas del virus SARS-CoV-2, con una longitud de más de 29 mil 500 nucleótidos por genoma. Los resultados del ensamblaje del genoma mostraron que no hubo errores de lectura ni espacios en blanco, y el trabajo se cumplió con una precisión casi absoluta.

En la actualidad, este es el único dispositivo en Vietnam, que no lee segmentos cortos sino largos. Los cortos solo leen en cien nucleótidos por fragmento y luego se ensamblan en un genoma completo. Pero para los largos se pueden leer hasta decenas de miles de nucleótidos por segmento. Este proceso hace más simple y preciso el montaje de secuencias para crear el genoma. La precisión es del 99,99%, es decir, casi sin errores de lectura y el montaje resulta muy rápido, ya que tan solo necesitan aproximadamente dos días para secuenciar, ensamblar y analizar el genoma de un virus.

Con este logro de Vietnam, se abre la posibilidad de secuenciar el genoma viral de forma rápida y precisa sin depender de las referencias o estudios internacionales.  Los datos de secuenciación del genoma contribuyen a determinar el origen del virus y el número de fuentes de infección (F0) en los brotes, estableciendo así una base científica y de información muy importante en el desarrollo de estrategias y planes de prevención y control eficaz de la propagación del virus en la comunidad.