En réponse, la police a immédiatement placé la zone du hall de l'aéroport en état d'alerte, entraînant l'évacuation du personnel et des passagers. Des forces de police spéciales, des unités mobiles et des experts en déminage tchèques et étrangers ont effectué des inspections approfondies à la recherche de matières explosives.

Après une demi-heure d'investigations, la police a conclu qu'il s'agissait d'une fausse alerte. Les opérations à l'aéroport Vaclav Havel ont repris normalement, mais avec des mesures de sécurité renforcées. Les autorités ont annoncé leur intention de poursuivre l'enquête sur l'auteur des appels téléphoniques menaçants et d'engager des poursuites pénales à son encontre.

L'incident de l'alerte à la bombe à l'aéroport s'est produit le jour de la Journée de deuil national en mémoire des victimes de la fusillade à l'Université Charles, survenue le 22 décembre, faisant 14 morts et 25 blessés.