Theo quyết định khởi tố, bị cáo Shibuya vào ngày 24/3 đã bắt cóc nạn nhân Lê Thị Nhật Linh lên ôtô với mục đích xâm hại tình dục, bị cáo đã sát hại nạn nhân và vứt xác tại bờ kênh ở thành phố Abiko. Hiện tại, bị cáo đang bị điều tra với các tội danh giết người và vứt bỏ thi thể. Đến thời điểm hiện nay, bị cáo vẫn tiếp tục im lặng. 

Nghi phạm Shibuya từng là hội trưởng hội phụ huynh trường tiểu học mà bé Linh theo học và đã bị bắt hồi tháng 3 vừa qua. Công tố viên đưa ra quyết định trên dựa trên nhiều bằng chứng, trong đó có mẫu ADN lấy từ thi thể nạn nhân trùng khớp với nghi phạm Shibuya và tóc được tìm thấy trên xe ôtô của nghi phạm trùng với mẫu ADN của nạn nhân.