Phát biểu tại lễ khai trường, Bộ trưởng Bộ Giáo dục và Đào tạo Phùng Xuân Nhạ khẳng định: Sự ra đời của Trường Đại học Việt Nhật là sự kết hợp hài hòa giữa nền giáo dục Nhật Bản, một trong những nền giáo dục hàng đầu thế giới và Đại học Quốc gia Hà Nội, trung tâm đào tạo, nghiên cứu hàng đầu Việt Nam với trình độ học thuật và chất lượng đào tạo được Việt Nam và thế giới đánh giá cao. Bộ trưởng Phùng Xuân Nhạ cũng ghi nhận những nỗ lực của Đại học Quốc gia Hà Nội trong công tác chỉ đạo, điều hành các hoạt động của Trường Đại học Việt Nhật thời gian qua; đánh giá cao sự nhiệt tình tham gia của các giáo sư, các nhà khoa học Việt Nam và Nhật Bản đã tận tình chung sức xây dựng các chương trình đào tạo, chuẩn bị các điều kiện cần thiết cho hoạt động của nhà trường.